南京市中小学卫生保健所成立于1984年11月。20多年来，在上级教育行政部门的领导下，在卫生部门的大力支持下，在广大学校教育、卫生工作者的全力配合下，全所人员奉行全心全意为人民服务的宗旨，敬业爱岗，诚实守信，以教育部、卫生部《学校卫生工作条例》为指南，坚持“学校教育，健康第一”的指导思想，全面贯彻教育方针，积极推进素质教育，竭诚为全市70多万中小学生的健康服务，形成了灵活高效的南京市学校卫生管理网络，有力地推动和保障了学校卫生保健工作的顺利开展。1991、1995、2004年我所先后被南京市委、市政府授予“南京市创建卫生城市立功单位” 、“南京市创卫先进集体”；1992、1996、2000年先后被南京市政府血地防领导小组授予“南京市血防工作先进集体”光荣称号；2000、2002年被市委、市政府授予“南京市文明单位”光荣称号；2001年被评为南京市教育局文明单位；在2003年南京市委思想政治工作联席会议上本所被授予2001~2003年度南京市思想政治工作先进集体称号；2004~2006年连续三年所党支部被市教育工委授予“先进基层党组织”的光荣称号；2001年度先后被授予南京市“巾帼文明示范岗”和江苏省“巾帼示范岗”光荣称号；2002年被卫生部、教育部授予“全国学生常见病综合防治先进集体”的光荣称号；2003年在抗击“非典”的过程中再次受到表彰，被评为“江苏省文明单位”；2004年获得“全国‘三八’红旗集体”荣誉称号；2005年被江苏省“巾帼建功”活动领导小组授予省级“巾帼示范岗明星岗”光荣称号，同时被南京市教育医务工会评为“南京市教卫系统五一巾帼标兵岗”称号，获得“南京零距离公众服务大奖”。由于我所出色地完成了1985、1991、1995、2000、2002、2004年教育部下达的全国学生体质健康状况调研任务，因此，2002年我所被教育部命名为“全国学生体质健康监测站”，2004年又被省教育厅命名为“江苏省学生体质健康监测站”。作为一个区域性的中小学卫生保健机构，南京市中小学卫生保健所坚持以《学校卫生工作条例》为依据，全面贯彻党的教育方针，扎实做好学校教育健康工作，促进中小学生养成良好的文明健康行为，努力提高他们的体质健康水平，为市委市政府提出的“建一流教育，创教育名城”的目标，实现两个“率先”，建设和谐南京做出应有的贡献。在学生的体质健康检测，学生常见病、血吸虫和地方病防治，学校健康教育和健康促进，学校卫生工作人员培训、学校卫生监督，对各种学校传染性疾病的防控和对突发公共卫生事件长效管理，实施市教育局下达的“学校卫生安全保障工程”，开展“学生体质健康增强年”活动，加强对学校卫生工作队伍的组织管理、科研以及学校红十字会等工作方面做了大量卓有成效的工作。在市教育局的领导下，南京市中小学卫生保健所承担了实施“南京市中小学生饮用水工程”及 推广和管理学生奶工程的任务。通过几年的努力，南京市已解决了60多万中小学生在校的饮水问题，成为在全国率先由政府和学校解决中小学生在校饮水问题的城市。全市有数万名学生坚持饮用“国家学生奶”，身体健康和素质得到了一定的提高。2002年3月开始，由中国疾病预防控制中心健康教育所牵头，南京市中小学卫生保健所具体负责实施了 “中国/WHO健康促进学校的推广与持续发展”项目。经过各级教育、卫生部门指导及学校的共同努力，目前我市共有12所健康促进学校，金奖学校1所，银奖学校7所，铜奖的学校4所。南京市中小学卫生保健所申报的科研课题《南京市中小学生体质健康状况十五年动态分析与对策研究》成为江苏省教育科学“十五”重点课题，并被江苏省教育科学规划办公室确定为经常性联系课题。2000年以来，所内人员参加了10余本书的编写工作，近百篇文章在市以上刊物上发表，多篇论文获省级以上奖项，有两篇论文在国际会议上交流。在新的形势下，南京市中小学卫生保健所全所人员正团结一心，与时俱进，开拓进取，为开创南京市学校卫生保健工作的新局面而努力奋斗。