台湾同胞联谊会，是在1979年元旦全国人大常委会发表《告台湾同胞书》和1981年9月叶剑英委员长进一步阐明关于台湾与祖国实现和平统一方针政策的背景下成立的。为了适应江苏省、南京市对台工作的需要，把党的统战政策深入到台湾省籍同胞当中，经省委、市委批准，省、市台湾同胞联谊会于1981年11月11日同时成立。目前我市台湾同胞有250户约700人，赴台定居台胞有100余人。

市台联组织成立初期，主要工作是摸底调查统计人数，协助有关部门为台胞落实中共中央[1981]38号文件，中央制定对台湾同胞要"一视同仁，并在各方面优先照顾"的有关政策，受到广大台胞的拥护，并调动了广大台胞的积极性。市台联努力办好"台胞之家"，负责帮助台胞寻亲、访友，对赴台探亲定居、子女高考加分等工作进行协助。每年的春节、中秋等传统节日，组织全市台胞举行联谊联欢活动。现阶段市台联以经济建设为中心，发挥优势，招商引资，成功促成11个台资项目，引入资金约千万美元。参政议政方面，台胞中的人大代表、政协委员在两会期间积极进言献策，并就台胞基本生活保障、台籍户籍登记等方面问题向市委市政府主要领导集中反映，得到妥善解决。其中关于《改善南京投资软环境》的提案被市政协列为主席督办提案，《残疾人按比例就业工作亟待健全组织、完善法规》、《建议加大对执法部门（公、检、法）纪检力度》等提案被市政协评为优秀提案。

加强与岛内的交流交往。2001年协办了"情系中山"夏令营活动，让30几位岛内的大中专学生了解历史，了解南京；2002年协办"锦绣江南行"夏令营活动，让台湾学生了解江苏，感受江南自然风光；2001年，组织我市部分青年台胞与岛内同胞参加"北京奥运.炎黄之光---海峡两岸长跑（南京站）"申办奥运活动，加强与岛内朋友的联系和沟通。