南京市环境保护科学研究院创建于1978年，是一家公益型环保科研机构，直属于南京市环境保护局。2006年3月经南京市编委批准完成了所改院。

我院技术力量雄厚，现有各类专业技术人员70余名,其中高级职称17名、中级职称22名、初级职称24名。环保科研大楼总建筑面积7000平方米, 拥有华东地区较大的水处理试验中心及环保产业研发基地，固定资产2250万元，具有较强的环境科研、环境咨询服务、环境工程设计以及环保产品开发、成果推广的能力，科研设计手段、装备、技术力量已形成规模, 体现出地区性环保科技产业发展优势。成立以来，先后完成了国家、省、市重点科研项目300余项，获得省科技进步奖6项，市科技进步奖18项。我院是江苏省AAA级信誉咨询机构，并通过了ISO9001国际质量管理体系认证。

我院持有甲级环评资格证书（证书编号：国环评证甲字第1907号），业务范围为轻工、纺织、化纤；化工、石化及医药；建筑、市政公用工程；区域开发；机械、电子；建筑材料；金属冶炼及压延加工；危险废物、医疗废物处置，是国家环保总局推荐的规划评价单位之一。近年来，主持编制了近千项建设项目环境影响报告书，在江苏省同行中享有极高的声誉。