1954年7月1日建成黑河气象站。1973年前管理体制经历了从军队建制到地方政府管理、再到地方政府和军队双重领导的演变；1973年-1979年，转为地方同级革命委员会领导，挂靠当地农牧部门；1981年自治区气象局开始对地、县级气象部门进行体制接收工作。1983年实行以气象部门为主、气象部门和地方政府双重领导的管理体制。那曲地区下辖嘉黎、班戈、索县、申扎、安多、比如气象站。
全地区气象部门1990年161人；2000年118人；2004年以后一直保持在121人。藏族81人，占职工总数的67%，汉族及其他少数民族40人，占职工总数的33 %；拥有初、中级职称的人数112人，占职工总数的93%；大中专毕业生103人，占职工总数的85%，本科以上学历28人，占职工总数的23%；副研级高级工程师4人、在读硕士研究生3人和博士研究生1人，占职工总数的7%。