鹿耳门溪是300馀年前郑成功驱荷复台时，最先进入的港道；今天，则是号称台南市唯一未受污染的河川。不论过去或现在，鹿耳门溪都具有不容抹煞的重要意义。

「鹿耳夕照」是古来闻名的自然景观，历经数百年沧海桑田的变化後，今天来到鹿耳门溪，沿著溪岸漫走，抬眼所见，除了潺潺的溪流与西斜的落日依旧外，归航的渔船、横卧的竹筏和遍植河道的蚵棚，更为这条台湾历史上地位特殊、影响至钜的港道，增添不少渔村风光。

「鹿耳门」原来不是溪名，而是一条可供船只航行的港道名称，因形状像鹿耳而得名 。道光年间，台江淤浅，原来浩瀚的汪洋，变成陆埔，而鹿耳门港道也历经多次浮沉异迁，最後变成一条细小流长的鹿耳门溪。

今天的鹿耳门溪上最叫人印象深刻的景观，要算是遍布河面的蚵棚和竹筏，这里是台南重要的养蚵场之一。