临沂市人民检察院下辖兰山、罗庄、河东、郯城、苍山、莒南、沂水、蒙阴、平邑、费县、沂南、临沭12个县（市、区）检察院，市院机关下设办公室、政治部、侦查监督处、公诉一处、公诉二处、反贪污贿赂局、反渎职侵权局、监所检察处、民事行政检察处、控告申诉检察处、职务犯罪预防处、检察技术处、法律政策研究室、警务处、行政装备处、监察处、离退休干部处、机关党委、人民监督员办公室、检务督察办公室等20个内设机构。目前，市院共有编制202个，实有151人。

近年来，该院坚持向班子建设要凝聚力，向文化建设要软实力，向教育培训要能力，向规范化管理要质量，向信息化建设要效率，充分发挥市院党组和市院机关的导向作用、示范作用、拉动作用，带头讲学习、讲政治、讲正气、顾大局，带头遵纪守法、廉洁自律，不办关系案、人情案、金钱案，带头团结向上，公道正派，努力营造“风正气顺心齐”、“想干会干干好”的良好氛围，带头办案，确立并实施了“市院带头、三区联合、全市合力”的办案思路，整合了办案资源，推动了办案工作的顺利开展。始终坚持“有作为有地位”，紧紧围绕市委、上级检察机关的部署谋划、推进检察工作，严厉打击严重刑事犯罪，积极查办和预防职务犯罪，加强诉讼监督，办案的数量多、质量高、效果好、方法活，为全市改革开放、经济发展作出了积极贡献。近年来，该院先后被高检院授予“基层检察院建设组织奖”、“全国计财装备工作先进集体”，被省委、省政府评为“人民满意政法单位”，两次被省院荣记集体一等功。近年来，先后有来自江苏、新疆等全国各地的300多个检察院的4230名检察官到该院参观交流。