说到两总界系统前,先介绍一下五界系统.

1969年,R.H.Whittaker根据生物的结构和营养方式的差异，把生物分为原核生物、原生生物、植物、真菌和动物的五界系统。他首先根据细胞的结构，把原核生物划分为原生生物界；又根据身体细胞的多少，把真核生物中的单细胞生物划分为原生生物界；最后再根据营养方式的不同，把多细胞生物中行光合作用的自养生物划分为植物界；营腐生生活的异养生物划分为真菌界；以摄食为主、有消化道的生物划分为动物界。

五界系统反映了生物进化的三个阶段和多细胞阶段的三个分支，是有纵有横的分类。它没有包括非细胞形态的病毒在内，也许是因为病毒系统地位不明之故。它的原生生物界内容庞杂，包括全部原生动物和红藻、褐藻、绿藻以外的其他真核藻类，包括了不同的动物和植物。

五界系统得到现代分子生物学资料的有力支持,很快被广泛接受,目前已成为生物分类的基础。

70年代以来，我国学者陈世骧（１９７７）及国外一些学者对五界系统提出修订，针对五界系统存在的问题提出一个更为完善的两总界（六界）系统．

两总界是指：原核总界和真核总界．