什么是biopython？

Biopython计划是一个使用python来开发计算分子生物学工具的国际社团。 该网址提供一个在线的基于python的生命科学研究的模块，脚本和网络链接。基本来说，我们喜欢使用python来编程，并且希望对生物信息学来说尽量容易的使用python创建高质量，可重用的模块和脚本。

在biopython工具包中能够发现什么

主要的Biopython发行版有很多功能,包括:

1，将生物信息学文件分析成python可利用的数据结构, 包括以下支持的格式：

Blast输出 – standalone和网络blast

Clustalw

FASTA

GenBank

PubMed和Medline

Expasy文件, 例如 Enzyme, Prodoc和Prosite

SCOP, 包括‘dom’和‘lin’文件

UniGene

SwissProt

被支持格式的文件可以通过记录来重复或者通过字典界面来索引。

2，处理常用的在线生物信息学数据库代码：

NCBI – Blast, Entrez和PubMed服务

Expasy – Prodoc和Prosite条目

3，常用生物信息程序的界面，例如：

Standalone Blast from NCBI

Clustalw 比对程序

一个标准序列类处理序列、ID和序列特征

对序列处理的常规操作，例如翻译，转录和重量计算。

代码以处理使用k最近邻接，Bayes或SVM进行分类

代码以处理比对，包括标准方法和处理替换矩阵

代码以轻易分解平行任务为分离的过程

GUI程序以进行基础的序列操作，翻译，BLAST等

使用模块的扩展文档和帮助，包括这个文件，在线wiki文档和网站以及mail列表和其他语言进行整合，包括Bioperl和Biojava计划, 使用BioCorba接口标准。我们希望这给了你足够的原因下载和开始使用Biopython!