采用浸入法将蛋白质从凝胶转移至硝酸纤维素膜是先将凝胶紧贴于一块硝酸纤维素膜，然后再将这种夹层组合浸入盛有大量缓冲液的转印槽内，使电流从转印槽的一侧通向另一侧(Towbinetal．1979)。通过电洗脱的方法可将蛋白质从凝胶中转印至滤膜上，如同在凝胶中迁移，只不过移动方向与胶平面垂直。若操作仔细，这是一种可将许多蛋白质转印至膜上非常有效的方法。此法比半干法稍微费时，也需用较多的缓冲液，但它更为简便。