1.组织拟订公路、水路行业科技、教育和信息化政策；拟订公路、水路行业科技和教育发展规划，并监督实施。
2.承担标准化管理有关工作；负责公路、水路有关国家标准、行业标准的相关管理工作；负责民航国家标准的相关管理工作；承担涉及综合运输体系的标准协调工作。
3.指导公路、水路行业科技创新体系建设；组织协调公路、水路有关国家级、部级科技项目研究；组织拟订有关部级科技项目计划并组织实施，指导行业科技成果转化和推广应用工作。
4.承担公路、水路行业产品质量和计量管理工作。
5.指导公路、水路行业信息化管理工作；负责部机关信息化工作。
6.指导公路、水路行业有关学科专业建设、职业教育和培训工作。
7.承办部领导交办的其他工作。
司 长：赵冲久
副司长：李祖平 洪晓枫
综合处
处 长：张 杰
科技发展处
处 长：
副处长：宫生晨
科技项目管理处
处 长：林 强
副处长：付光琼
信息化管理处（部信息化工作领导小组办公室）
处 长：邹 力
副处长：姚俊峰
教育培训处
处 长：于 敏