吉林省农业科学院作物育种研究所主要从事高粱、小麦、谷子、向日葵、大麦、糜子和杂豆的新品种选育和推广。我所现有科技人员25名，其中研究员4名，副研究员7名，博士2名，硕士1名。研究所设所办公室、高粱一、二、三研究室、小麦研究生、谷子研究室、杂粮、杂豆研究室、新品种开发室。

20世纪60年来，吉林省农业科学院作物育种研究所先后承担国家、省部级科技攻关项目28项，取得科技成果19项，获得国家发明三等奖1项，获国家发明专利2项，省科技进步二等奖2项。先后培育出高产、优质、多抗高粱杂交种吉杂52号、吉杂83号、四杂25号等50余个，以及公谷68号、丰强11号、公绿2号等系列优质谷、麦、豆品种。品种种植区域达到辽宁、吉林、黑龙江及内蒙古东部广大地区，部分品种出口日本。

目前，推广品种主要是高抗蚜虫的高粱杂交种四杂25号：株高170厘米，生育期124天，公顷产量8600公斤，公顷保苗10万株，适宜吉林省中西部、内蒙古东部和黑龙江省南部地区种植。酿造型高粱杂交种83号：抗丝黑穗病，株高169厘米，生育期120天，公顷产量8600公斤左右，公顷保苗14万株，适宜吉林省中西部、内蒙古东部和黑龙江省南部地区种植。高产早熟耐密型高粱杂交种90号：抗丝黑穗病，株高135厘米，生育期114天，公顷产量8500公斤左右，公顷保苗15万株，适宜吉林省中西部、内蒙古东部和黑龙江省中西部地区种植。还有各种专用型高粱杂交种四杂29号、吉杂80号、吉杂76号、四杂31号、四杂36号等。优质强筋春小麦新品种丰强7号、丰强11号等。优质谷子新品种公谷63号、公谷65号、公谷68号、其它作物品种有红小豆品种吉红6号，绿豆品种公绿2号，油用向日葵杂交种公杂1号、2号等。其中高粱品种已占品种适宜区的90%以上，累计推广面积达7000万亩，增产粮食42亿公斤，创社会效益33.6亿元。这些品种不仅为东北粮食生产作出突出贡献，也为广大农民增收创造了一定的经济效益。