吉林措巴寺位于扎囊县扎塘镇吉林村，1224年，由强久贝修建。整个建筑布局结构与同期的葱堆措巴类似，总占地面积约5200平方米。

建筑坐北朝南，围绕主殿有一周长方形的围墙，南北长85米，东西宽66.5米，墙厚1米，高3米。在围墙外有一周宽约5米的壕沟，贴围墙内壁原有一周二层楼的僧舍，现已不存。另外，吉林措巴寺除南围墙的正大门外，在西、北两面围墙上还各有一个较小的偏门。主殿位于围墙内中部，共有三层建筑，高11米。第一层中部是原石墙的地基，第二层为主殿正殿，第三层的建筑多为小房间。