基本信息

主要学习工作简历(主要学习简历 主要工作简历)

主要研究方向

承担的科研项目(一、主持项目 二、参与项目)

主要研究成果

获奖情况

基本信息

黄艳新，男 ，1967年3月出生，东北师范大学生命科学学院和计算机科学与信息技术学院副教授。目前主要从事生物信息学和系统生物学的理论和应用研究。承担本科生的《生物信息学》课程的教学工作。承担完成国家和省部级科研项目十余项，在国际、国内重要学术期刊发表论文30余篇，获省部级科技进步一等奖一项。曾应邀为SCI期刊源杂志“Immunological Investigations”和“Molecules”等杂志审稿。

主要学习工作简历

主要学习简历

1985.9-1989.7 北京理工大学应用数学系应用数学专业 本科生

1996.9-1999.3 长春理工大学计算机学院计算机应用专业 硕士研究生

2001.9-2004.12 吉林大学计算机科学与技术学院计算机应用技术专业 博士研究生

主要工作简历

1989.7-1996.8 长春第一汽车制造厂 助理工程师

1993.3-1994.5 日本共和电脑株式会社、日本富士通株式会社 工作、研修

1999.3-2009.4 吉林大学计算机科学与技术学院 讲师、副教授

2006.12-2008.12 东北师范大学遗传与细胞研究所 博士后

2009.4至今 东北师范大学生命科学学院 计算机科学与信息技术学院 副教授

主要研究方向

一、细胞信号转导网络的计算系统生物学建模研究

二、计算机辅助药物分子设计研究

三、抗原表位预测研究

四、生物信息学软件和数据库开发研究

承担的科研项目

一、主持项目

[1]细胞凋亡信号转导网络多尺度建模及其在新抗肿瘤药物靶标识别方面的应用研究. 国家自然科学基金项目（61172183）. 2012.1-2015.12. 资助金额60万元, 项目负责人.

[2]中药有效成分和药物分子作用靶标的计算机虚拟筛选. 吉林省中医药管理局资助项目(2010pt067). 2010.12-2011.12. 资助金额1万元，项目负责人.

[3]细胞凋亡信号转导网络的计算建模研究(20101503)，省科技厅自然科学基金项目，2010.1-2012.12，资助金额5万元，项目负责人.

[4]基于噬菌体展示库的B细胞构象性表位预测算法及其应用研究(20080431048)，中国博士后科学基金项目，2006.12-2008.12，资助金额3万元，项目负责人.

[5]机器味觉识别研究，吉林大学青年教师科研基金，2002.12-2004.12，资助金额1.5万元，项目负责人.

二、参与项目

[1]基于计算智能味觉信号识别方法的研究，国家自然科学基金，2006.1-2008.12，资助金额26万元，主要参加人.

[2] 抗肿瘤新药--重组人血管抑素，教育部产学研结合项目，2007.9-2011.12，资助金额50万元，主要参加人.

[3]重组人血管抑素研究，吉林省科技发展计划重点项目，2007.10-2010.12，资助金额20万元，主要参加人.

[4]关于进化计算运行机理分析与应用的研究，教育部重点资助项目，2002.12-2004.12，资助金额7万元，主要参加人.

主要研究成果

[1]Pingping Sun, Wenhan Chen, Yanxin Huang*, Hongyan Wang, Zhiqiang Ma*, Yinghua Lv*. Epitope prediction based on random peptide library screening: Benchmark datasets and prediction tools evaluation. Molecules 2011.16(6):4971-4993.

[2]Wen Han Chen, Ping Ping Sun, Yang Lu, William W Guo, Yan Xin Huang*, Zhi Qiang Ma*. MimoPro: a more efficient Web-based tool for epitope prediction using phage display libraries. BMC Bioinformatics 2011, 12:199.

[3]Song Z, Bao Y, Zhang Y, Mi X, Wu P, Wu Y, Yu C, Sun Y, Zheng L, Huang Y, Liu B, Li Y. Testes-specific protease 50 (TSP50) promotes cell proliferation through the activation of the NF-kappa beta (NF-κB) signaling pathway. Biochem J. Biochem J. 2011 Jun 1;436(2):457-67.

[4]Ying Shi. Yong Li Bao. Yin Wu. Chun Lei Yu. Yan Xin Huang. Ying Sun. Li Hua Zheng. Yu Xin Li. Alantolactone Inhibits Cell Proliferation by Interrupting the Interaction between Cripto-1 and Activin Receptor Type II A in Activin Signaling Pathway. Journal of Biomolecular Screening. 2011; 16 ( 5 ): 525-535.

[1]Zhang Y, Bao YL, Yang MT, Wu Y, Yu CL, Huang YX, Sun Y, Zheng LH, Li YX. Activin A induces SLC5A8 expression through the Smad3 signaling pathway in human colon cancer RKO cells. Int J Biochem Cell Biol, 2010, 42:1964–1972.

[2]Miao Wang, Yong-Li Bao, Yin Wu, Chun-Lei Yu, Xiang-Ying Meng, Yan-Xin Huang, Ying Sun, Li-Hua Zheng, Yu-Xin Li. Basic FGF Downregulates TSP50 Expression via the ERK/Sp1 Pathway. Journal of Cellular Biochemistry. 2010, 111: 75-81.

[3]Y. Zhang, L. Zhou, Y.L. Bao, Y.Wu, C.L. Yu, Y.X. Huang, Y. Sun, L.H. Zheng, Y.X. Li, Butyrate induces cell apoptosis through activation of JNKMAP kinase pathway in human colon cancer RKO cells. Chem. Biol. Interact. 2010, 185:174-181.

[4]Zhou L, Bao YL*, Zhang Y, Wu Y, Yu CL, Huang YX, Sun Y, Zheng LH and LiYX*. Knockdown of TSP50 inhibits cell proliferation and induces apoptosis in P19 cells. UBMB Life. 2010 Nov; 62(11): 825-832.

[1]Song Zhenbo, Bao Yongli, Wu Yin, Yu Chun lei, Huang Yanxin, Li Yuxin: Testes-Specific Protease 50 Promotes Tumorigenesis through Activation of NF-kB Signaling Pathway. 21st IUBMB & 12th FAOBMB International Congress of Biochemistry and Molecular Biology. 2009, 8: 59.

[1]YX Huang, YL Bao, SY Guo, Y Wang, CG Zhou, YX Li: Pep-3D-Search: a method for B-cell epitope prediction based on mimotope analysis. BMC Bioinformatics, 2008, 9:538.

[2]黄艳新, 鲍永利, 李玉新: 抗原表位预测的免疫信息学方法研究进展. 中国免疫学杂志, 2008, Vol 24, No 9, pp 857-861.

[3]SX Zou, YX Huang, Y Wang, CG Zhou: A Novel Method for Prediction of Protein Domain Using Distance-Based Maximal Entropy. Journal of Bionic Engineering 2008, Vol. 05, No. 03, pp 215-223.

[1]Y Wang, XY Feng, YX Huang, DB Pu, WG Zhou, YC Liang and CG Zhou: a novel quantum swarm evolutionary algorithm and its applications. Neuro-computing, volume 70 (issues 4-6), January 2007, pp: 633-640.

[1]Huang YX, Zhou CG, Wang Y, Bao YL, Wu Y, Li YX: A hybrid algorithm for solving generalized class cover problem. The 2nd International Conference on Natural Computation (ICNC'06), Xi’an China, Proceedings, Sep. 2006, Parts I, pp 610-619.

[2]Zou SX, Huang, YX, Wang, Y, Zhou, CG: Prediction of protein domains from sequence information using support vector machines. Third International Symposium on Neural Networks (ISNN 2006), Proceedings - Part III, 2006, pp 674-681.

[3]王岩, 路春一, 丰小月, 黄艳新, 邹淑雪, 周春光: 一种新的量子群进化算法研究. 小型微型计算机系统, 2006, Vol. 27, No. 8, pp 1478-1482.

[4]邹淑雪, 王岩, 周春光, 黄艳新: 一种基于支持向量机的模糊分类系统研究. 小型微型计算机系统, 2006, Vol. 27, No.4, pp 701-705.

[1]Huang YX, Zhou CG: Recognizing Taste Signals Using A Clustering-based Fuzzy Neural Network. Chinese Journal of Electronics, Jan. 2005. Vol. 14, No.1, pp 21-25.

[2]YX Huang, Y Wang, WG Zhou, ZZ Yu, CG Zhou: A Fuzzy Neural Network System Based on Generalized Class Cover and Particle Swarm Optimization. 2005 International Conference on Natural Computation (ICNC'05) ICIC (2), Hefei, China, 2005: 119-128.

[3]Y Wang, XY Feng, YX Huang, WG Zhou, YC Liang and CG Zhou: A Novel Quantum Swarm Evolutionary Algorithm for Solving 0-1 Knapsack Problem. Advances in Natural Computation, First International Conference (ICNC2005), Chang-Sha, China, Vol. 3611, 2005: 698-705.

[4]Liu GX, Zhu YX, Zhou WG, Huang YX, Zhou CG, Wang RX: A Study on Protein Residue Contacts Prediction by Recurrent Neural Network. Journal of Bionics Engineering. Sep. 2005, Vol. 2, No. 3, pp 157-160.

[5]黄艳新, 周春光, 邹淑雪, 王岩: 一种求解类覆盖问题的混合算法. 软件学报, 2005, Vol. 16, No. 4, pp513-522.

[6]王岩, 周春光, 黄艳新, 丰小月: 基于最小不确定性神经网络的茶味觉信号识别. 计算机研究与发展, 2005, Vol. 42, No. 1, pp 66-71.

[1]Huang YX, Wang Y, Zhou CG, Zou SX, Yang XW and Liang YC: Reduction and Optimization For A Support-Vector-Machine-Based Fuzzy-Classification-System. Proceedings of the Third International Conference on Machine Learning and Cybernetics, Shang-Hai, China, 26-29 August, 2004, pp 3402-3407.

[2]Huang YX, Zhou CG, Zou SX, Wang Y and Liang YC: A Rough-Set-Based Fuzzy-Neural-Network System For Taste Signal Identification. 2004 International Symposium on Neural Networks Proceedings (Part II), Da-Lian, China, 19-21, August, 2004, pp337-343.

[3]Wang Y, Zhou CG, Huang YX, Feng XY: Training Minimal Uncertainty neural Networks by Bayesian Theorem and Particle Swarm Optimization. 11Th International Conference on Neural Information Processing, Nov. 2004, Calcutta, India, pp 579-584.

[4]Y. Wang, CG Zhou, YX Huang, YC Liang and XW Yang: A Boundary Method to Speed up Training Support Vector Machines. The International conference on Computational methods (ICCM2004), National University of Singapore, dec. 2004, Part II, pp 1209-1213.

[5]黄艳新, 周春光, 邹淑雪, 王岩: 一种基于类覆盖和粒子群优化的模糊神经网络系统. 计算机研究与发展, 2004, Vol. 41, No.7, pp 1053-1061.

[6]黄艳新, 周春光, 杨国慧, 邹淑雪: 基于熵聚类模糊神经网络味觉信号识别的研究. 计算机研究与发展, 2004, Vol 41, No.3, pp414-419.

获奖情况

(1)参加完成科研项目“智能计算建模及应用研究”，并作为主要完成人之一获得吉林省科学技术进步一等奖（获奖时间：2007年12月）。

(2)博士论文“计算机味觉信号识别的研究”被评为吉林大学2007年优秀博士学位论文二等奖（获奖时间：2007年11月）。