1963年6月14日出生于四川省成都市。1985年7月毕业于北京清华大学工程物理系团体物理及材料科学专业，获工学学士学位。同年9月在该系材料科学专业攻读硕士学位，1986年12月转至金属物理专业攻读博士学位。1988年12月毕业于材料科李与工程系，获工学博士学位。1988年12月开始在清华大学材料科学与工程系任讲师。1989年7月起成为中国高等科学技术中心成员。他参与了国家自然科学基金资助的"离子束作用下的相形成及相变"、"合金相的电子结构"及"合金薄膜中的分形、准晶及自发非晶化"等课题的研究。迄今，已在国际、国内的重要学术刊物（例如，《物理评论快报》、《物理评论人《应用物理杂志（美）》等和国际学术会议上发表学术论文30余篇，论文总字数达10万余字。上述研究获得了很好的成果。美国有关专家在评审他关于固体薄膜中集团生长的一篇论文时指出：论文所阐述的物理思想是十分有意义的，并能启迪新的思想和实验。他的另一篇关于磁相变与不可公度相的论文被认为是"极为有意义的发现。"黄立基的博士论文在提交同行专家评审时，30余位专家一致认为：作者具有突出的创造能力和开辟新的研究领域的能力，具有较高的学术水平。