督查中心主要职责包括：负责监督检查环境保护法律、法规、标准的执行情况；承办重大环境污染与生态破坏案件的调查工作；承办跨设区市环境纠纷协调处理工作；承办或参与流域环境执法稽查工作；督查重点污染源污和省审批建设项目“三同时”执行情况。另外，对涉及子牙河流域、白洋淀区域6市的环境信访举报、环境应急、污染源自动监测、秸秆禁烧、重点污染源管理、人员培训、能力建设等项工作，实行省环保局、环监局统一归口管理，统一安排部署，分头承办参与，统一汇总统计。

督查中心下设综合科、督查一科、督查二科3个科室。综合科主要负责督查中心人事、党群、文秘、档案、行政后勤等综合管理工作；督查一科主要负责子牙河流域5市（石家庄、邯郸、邢台、衡水、沧州）的环境执法督查工作；督查二科负责白洋淀区域（主要是保定市）的环境执法督查工作。