海口中心学校成立于2004年，系海口镇教委和中心小学合并而成，负责全镇小学教育行政、人事、经费和教学业务管理，辖14所完小和2所初小。全镇小学在编教职工160余人，退休(养)教职工80多人，小学教学班110个，在校学生3600人，附设学前班8个，在校幼儿200余人。

海口中心学校本部设在海口镇工业园区，占地22亩，建筑面积2000平方米，在校学生700人，教职工40人，是海口镇规模最大的一所完全小学。

海口镇现有小学基本创建于20世纪50年代初期和中期，初建时仅有南埂、海口、培文三所完小，其余均为初小或教学点，至六十年代后期发展成为“一村一完小”的格局。这一时期，由于小学不仅担负普及初等教育的任务，还肩负农民扫盲教学工作，各村在办好一所完小的基础上，还根据实际需要设立了许多民办教学点、夜校，直至七十年代后才陆续撤销，并入村完小。

1985年，怀宁县实施乡镇区划调整，红星乡划分为巨网乡和红星乡，同时将洪铺镇部分村划入巨网乡，小学教学业务管理分别由巨网中心小学(设在镇江小学)和红星中心小学(设在南埂小学)承担。1987年，乡镇教委成立，由巨网乡教委和红星乡教委分别负责两乡教育行政管理。1992年，怀宁县实行撤乡并镇，巨网乡和红星乡合并成立海口镇，教育机构也随之改变，撤销巨网乡教委和红星乡教委，成立海口镇教委；撤销巨网中心小学、红星中心小学，成立海口中心小学，校址设在南埂小学。2003年9月，海口中心小学迁入新址。

2004年，安徽省实施乡镇教育机构改革，撤销乡镇教委和中心小学，成立中心学校下辖皖江、海口、红星、培文、义湖五个辅导区。