贵港市疾病预防控制中心是2003年新组建的副处级公益性事业单位，设疾病控制科、计划免疫科、公共卫生科等十三个科室，现有在职干部职工和聘用人员92人，其中本科13人，大专25人，占41．3％；高级职称3人，中级职称28人。现有工作用房4500平方米，其中实验室用房近2000平方米，百级无菌室1个，千级无菌室1个和万级无菌室4个共6间，拥有原子吸收分析仪，气相色谱仪、自动生化分析仪、PCR、有毒有害气体快速检测仪等一批先进检测仪器设备。

贵港市疾病预防控制中心成立以来，加强了流行病学调查，突发公共卫生事件应急处理、检验检测等疾控三大能力和疾病预防控制的信息网建设，各项工作取得了显著的成绩。2003年获得了国家人事部、卫生部授予“全国卫生系统抗击非典先进集体”，广西区党委、区人民政府授予“全区非典型肺炎防治工作先进集体”光荣称号。2005年1月通过了自治区卫生厅组织的职业卫生技术服务机构资质评审和艾滋病筛查实验室评审。2005年3月通过了广西质量技术监督局的计量认证评审，取得中华人民共和国计量认证合格证书，检验检测机构提升为省级。