广东省海洋开发研究中心于2000年11月26日在广东海洋大学挂牌。广东海洋大学为主任单位，中山大学、中国科学院南海海洋研究所、中国水产科学院南海水产研究所、国家海洋局南海分局为副主任单位。广东省海洋开发研究中心主任由广东海洋大学校长担任，下设办公室、技术研究部、技术开发部、信息与培训部。下属湛江海洋高新科技园、广东海洋大学海洋经济研究所和海洋药物研究与开发实验室。

广东省海洋开发研究中心的主要任务是：组织、协调广东省内涉海科研单位和高等院校的科技力量，研究海洋开发的高新技术，进行海洋科技成果转化，海洋产业优化升级，为政府职能部门提供海洋产业发展科技咨询等服务；建立海洋科技人才库、成果库和开放实验室，为海洋事业的可持续发展提供科技支持。