功能性磁共振成像系统（functional magnetic resonance imaging缩写成fMRI）是将传统共振成像的高分辨率解剖成像能力与核示踪的血流动态特异性结合起来,将人脑的功能像精确地投影到基本的解剖像,从而成为研究大脑认识思维活动的强有力的工具。

功能性磁共振成像能够直观、形象地观测认知任务过程中大脑活动情况，并且具有较高的时间和空间分辨率，这较传统的神经检查、WADA测试、单视野呈现、双耳分听和脑电等具有不可比拟的优势。认知过程包括感知觉、注意、记忆、思维和语言等，是一个非常复杂的过程。fMRI的应用将指导临床医学对大脑更深的认知（如解剖与功能分区，病理定位等）起到普通磁共振（MRI）不可替代的作用。