甘肃镇总兵驻今甘肃张掖，所辖边墙东起景泰县黄河岸，另有一分支起自兰州市北河岸，北到景泰县西北境会合成一线，斜向西北，经民勤、永昌、山丹、张掖、高台、酒泉诸县境，又绕过嘉峪关市向南，抵达祁连山北麓而止，长一千六百馀里。沿线重要关隘有甘州卫、肃州卫（酒泉）、永昌卫（永昌）、凉州卫（武威）、镇番卫（民勤）和嘉峪关等处，尤以嘉峪关最为重要。