《复杂系统与复杂性科学》杂志是2002年11月经国家科技部批准创立的，国内外公开发行，季刊。由中国科学院院士、中国自动化学会理事长戴汝为院士、我校复杂系统与复杂性科学研究所所长张嗣瀛院士担任主编。这份杂志也是中国自动化系统复杂性专业委员会的会刊。科学出版社承担该杂志的出版发行工作。

《复杂系统与复杂性科学》杂志主要刊登复杂系统与复杂性科学领域创造性的研究论文，理论与实践研究的最新成果，也适当刊登专题综述、学术动态、书刊评价等文章。设有研究论文、科学研究简报、成果的应用与转化、综述与评论、信息与动态以及报告与书评等栏目。

本刊的办刊宗旨是科教兴国，努力研究复杂系统与复杂性科学理论，用现代化科学理论指导复杂性科学研究的深入开展。该刊的读者对象是大专院校、科研院所的科研人员、教师、研究生、高年级大学生，政府部门、厂矿企业的学术研究人员等。

2004～2007年本刊所载论文中国家自然科学基金项目占57.46%。在2007年9月"中国科学文献计量评价研究中心"所作的《中国学术期刊综合引证年度报告（2007）》中《复杂系统与复杂性科学》的影响因子为0.767