芳苑乡地处滨海，民都以渔业为生，习近神道，鲜闻佛法。民国五十八年(1969)，先有地方善信林深渊、黄金丸、黄月香、黄金丝献地百坪，并善士沈朱、陈英、洪注、洪娶、刘如观、吴乌格、吴观诚等发心筹建梵寺。礼请释真慧、真运、真香叁师，偕弟子如庄、如延、如玄叁仁者，共谋募造。

缁素输诚，辛勤肇荆，殿宇寮舍始渐粗具。善男信女于潜移默化中，得以皈向叁宝，法化宏开，来礼拜祈求者益众，逐一转而为乡民信仰中心。然宝殿年久日远，每值节庆，信徒接踵，实有待整治扩建。民国七十二年(1983)决议重修。乃增地整划，大举兴工。有大雄、弥陀宝殿各一，讲堂、斋堂、僧舍、禅房、叁楼建物计千余坪，并园林池阁，美尽自然，七十七年(1988)工程告竣。早年的普济寺是平房式的建筑，花园草木扶疏，很有庭园乐趣。民国72年改建后的普济寺是叁层高的宫殿建筑，从台17号公路望见普济寺，更显得醒目庄严。在距离几步之遥的大殿左侧还增筑了纳骨塔一座。普济寺是芳苑佛弟子的信仰中心，几十年来接引了无数的乡民，令人赞叹!