二方密码（en:Two-square_cipher）比四方密码用更少的矩阵。

得出加密矩阵的方法和四方密码一样。

例如用「example」和「keyword」作密匙，加密lp。首先找出第一个字母（L）在上方矩阵的位置，再找出第二个字母（p）在下方矩阵的位置：

E X A M P

L B C D F

G H I J K

N O R S T

U V W Y Z

K E Y W O

R D A B C

F G H I J

L M N P S

T U V X Z

在上方矩阵找第一个字母同行，第二个字母同列的字母；在下方矩阵找第一个字母同列，第二个字母同行的字母，那两个字母就是加密的结果：

E X A M P

L B C D F

G H I J K

N O R S T

U V W Y Z

K E Y W O

R D A B C

F G H I J

L M N P S

T U V X Z

help me的加密结果：

he lp me

HE DL XW

这种加密法的弱点是若两个字同列，便采用原来的字母，例如he便加密作HE。约有二成的内容都因此而暴露。