第四世代（第四世代、Generation IV），指的是第四批口袋妖怪（387~493）登场的游戏所对应的时期。
珍珠·钻石·白金对应的游戏世界为神奥地区。心金·魂银对应的游戏世界为城都地区。
新增了107只怪兽，精灵总数达到493只。
新增了113个新技能，技能总数达到467个。
增加了47个新特性，部分第四世代以前的精灵获得了新的特性。
每个技能的伤害类型细化，技能不再依靠属性决定物理或特殊攻击。
口袋妖怪珍珠（2006）
口袋妖怪钻石（2006）
口袋妖怪白金（2008）
口袋妖怪金心（2009）
口袋妖怪银灵（2009）