蔡存远（？-？）字思毅，福建晋江县人。明朝官员。
蔡存远为蔡文庄第四子。嘉靖五年（1526年），蔡存远中式丙戌科三甲进士。历任吉安、松江二府推官，擢太仆寺丞。平生笔录有《宋鉴摘要》、《胡传摘文批》、《续程文批点论则》及《进呈易经蒙引表》。自著有《周易正说》。清道光《晋江县志》有传。
《晋江县志·卷之五十六·人物志·文苑之二》：蔡存远，字思毅，文庄第四子。嘉靖丙戌进士，历任吉安、松江二府推官，擢太仆寺丞。生平笔录有《宋鉴摘要》、《胡传摘文批》、《续程文批点论则》及《进呈易经蒙引表》。自著有《周易正说》。