北京三九药业有限公司前身是于1972年成立的北京市东风制药厂。1997年3月由三九企业集团兼并重组后更名为北京三九万东药业有限责任公司；2002年搬迁至中关村科技园昌平园区后，更名为北京三九药业有限公司。2007年9月，公司被华润集团收购，历时至2009年7月，公司转为华润集团控股。经过三十多年的发展，确立了在医药和保健品行业的领先地位。公司已通过GMP认证。通过GMP认证的产品线包括片剂（含头孢菌素类）、胶囊剂（含头孢菌素类）、颗粒剂（含头孢菌素类）、散剂、合剂（含口服液）、糖浆剂、口服溶液剂。 本公司现有一个液体制剂车间和两个固体制剂车间（制粒车间、头孢车间）。液体制剂车间采用全套德国进口的口服液生产线；固体制剂车间采用国内领先的固体制剂生产线。公司所有人员均接受了系统的GMP培训和药品法规的培训并经过严格的考核，其中专业技术人员占员工总数的41%。拥有先进的生产设备、强大的技术力量和严格的生产管理保证了我公司产品的质量。

作为一个中西药相结合的制药企业，公司现有品种143个，其中在国家基本用药目录中有30个品种，保险用药目录54个品种，公费医疗用药20个品种，OTC类药品三十余种。主要产品有新生代北京人参蜂王浆（保健食品）、赖氨酸维B12颗粒、小儿氨酚黄那敏颗粒、胃痛片、盐酸黄酮哌酯片（渡洛捷）、头孢菌素类（头孢拉定胶囊、头孢氨苄片、复方溴咖片、头孢氨苄胶囊、头孢氨苄甲氧苄啶胶囊、头孢氨苄甲氧苄啶片）、清热解毒品服液、甘露聚糖肽口服溶液（贝亚宁）、小儿腹泻宁糖浆、磷霉素钙甲氧苄啶胶囊（君捷亭）等。

北京三九拥有着年轻炽热的心、怀着永不言败的热情、发扬着团结一致的精神，始终坚持以“以人为本，确保产品质量”为前提，以“健康、良好、持续的发展”作为公司追求的目标，以关爱员工、增强凝聚、倡导文明、促进和谐为己任，不断完善公司制度、提高公司员工整体素质、发展企业自身文化、拓展公司未来发展方向。我们坚信，在不久的将来，北京三九为客户所提供的不仅是放心治疗服务，更是舒心售后服务。我们也相信，依托华润集团强大的后盾，北京三九的未来代表的不仅是华润的精神和三九的理念，更是北京三九自身的“魂”。