包裹体同位素分析（fluid inclusion isotopic analysis）是利用包裹体流体进行稳定同位素和同位素年代学研究。稳定同位素研究主要有氢（D/H）、氧（18O/16 O）、碳（13 C/12 C）、氮（15 N/14 N）和硫（34S/32S）同位素测定。年代学研究主要用氩一氩法和铷一锶法和钐一钕法。包裹体同位素研究能为成岩成矿流体介质的可能来源、成岩成矿环境和矿床成因提供更直接可靠的重要信息。