安徽亳州工业园区是在2003年亳州市人民政府批准的亳州市民营工业园区和国家农业部批准的农业综合开发区基础上，整合而成。2006年4月被省人民政府批准为省级工业园区，2006年5月通过国家发改委审核认定，并正式定名为安徽亳州工业园区。亳州工业园区隶属于谯城区，位于亳州市城区西南部，规划占地面积10.44平方公里。园区分设三大功能分区： A区，原亳州市民营工业园区，批准规模300公顷，主要分布在西外环路两侧，以农副产品深加工、中药饮片提取为主导产业；B区，原亳州市综合开发区十八里工业区，批准规模160公顷，主要分布在十八里镇311国道两侧，以现代中药产业为主导产业；C区，原亳州市综合开发区魏岗工业区，批准规模100公顷，主要分布在亳魏路两侧，以化工及超硬材料为主导产业。三大功能分区依托311、105国道和涡河流域形成了一个主业突出、多举并举、各具特色、三足鼎立的态势。