患者主索引（Enterprise Master Patient Index，EMPI）是二十世纪未出现的医疗信息化专业用语，简单来说，它是患者基本信息检索目录。其主要用途是在一个复杂的医疗体系内，通过唯一的患者标识将多个医疗信息系统有效地关联在一起。以实现各个系统之间的互联互通，保证对同一个患者，分布在不同系统中的个人信息采集的完整性和准确性。建立患者主索引是实现大型医院内部系统集成，医院集团内资源共享，以及建立居民健康档案实现区域医疗共享的必要条件。

患者主索引在医院的作用随着医院信息化建设的发展,从原有HIS系统的基础上,逐步发展出LIS、RIS/PACS、手术麻醉、病理、心电、重症监护(ICU/CCU)、ERP等系统.这些不同的系统可能来自不同的提供商,每个系统的架构、数据格式、编码标准可能不同,致使不同系统的患者信息和临床信息不能实现共享.为了解决达样的问题,一些HIS厂商托管了患者信息管理的职能,而且加强了对其他系统的开放接口.