虽然目前Linux的易用性越来越好了，但是偶尔仍然还是需要在Linux上运行Windows应用程序，一直以来都采用Wine来实现。Wine目前已经支持了很多Windows的应用程序，而来自CodeWeavers的CrossOver Linux则更进一步，Microsoft Office(97-2007)、IE、Quicken甚至Adobe Photoshop CS3都可以完美运行在Linux上。CrossOver并不是一个全新的虚拟层，他同样基于Wine，但它完善了一系列Windows API在Unix/Linux上的兼容性。