CALIS全国医学文献信息中心(CALIS National Information Center in Medicine)设立在北京大学医学图书馆，是CALIS根据学科下设的文理、工程、医学、农学四个全国中心之一，于1998年正式成立。

作为 CALIS全国医学中心，其承担的主要任务是通过与各高等院校医学图书馆的合作与交流，在各馆的密切配合和支持下，协调高校医学图书馆丰富的文献资源和人力资源，共同建设高等院校医学文献联合保障体系。同时，建立与全国医药信息网高效、快捷地连接，提供强大的网上检索服务和文献传递服务，实现全国高校医学图书馆间资源共建、共知、共享。