舟山医院城南院区（舟山市妇幼保健院）组建于一九九四年底，医院占地面积1.2万平方米，总建筑面积2.97万平方米，是一所集医疗、保健、科研为一体的三级乙类专科医院，是全市100万人口的妇幼保健中心。 医院在编职工495名、卫技人员438名，其中高中级职称专业技术人员占62.55%。医院分临床、保健二大部分，设有10个病区，开放床位300张，开设专家专科门诊60多个。2007年门急诊57.68万人次，住院1.2万人次。医院拥有16排螺旋CT、数字胃肠机、中央胎心监护系统、腹腔镜、宫腔镜、汽化电切镜等十万元以上的大型仪器设备106台，为医疗、保健、科研提供了较好的工作条件。

建院来，医院立足海岛，克服群众居住分散、交通不便，资源共享性差等困难，坚持妇幼卫生工作方针，贯彻实施《母婴保健法》，坚持走保健与临床互相促进共同发展之路，使舟山市妇幼卫生事业得以蓬勃发展。全市各项妇幼卫生工作质量指标始终位于省内先进行列。建院14年来，13年未发生孕产妇死亡，婴儿死亡率、五岁以下儿童死亡率持续走低，成绩在省内引人瞩目。

医院的生殖内分泌、妇科肿瘤、儿童呼吸、儿童消化、围产医学、儿童内分泌等学科分别为市级、市局级重点学科，在这些学科的带领下，医院在妇、产、儿科方面技术水平市内领先，为医院树立了品牌。 在“三个代表”重要思想指导下，医院本着为海岛群众带进先进技术、便捷服务的工作宗旨，坚持走技术创新之路，陆续设立了一些特色中心，有乳腺疾病防治中心、产前诊断中心、新生儿疾病筛查中心以及与上海、杭州等地大医院合作的针推康复中心、介入治疗中心、皮肤病防治中心等。开展亚健康体检、婴儿游泳、婴儿抚触等特色服务。

医院成立来，先后获得国家级爱婴医院、全国杨崇瑞妇幼卫生基金奖、全国“三八”红旗集体、全国卫生系统先进集体、全国“明明白白看病”百姓放心医院、省产科质量优胜单位、省98’服务质量信得过单位、省99’公众形象优秀医疗场所、省优生优育工作先进单位、市级文明单位、市重才爱才先进单位等荣誉称号。院儿科被国家卫生部、全国妇联命名为全国卫生系统护理专业“巾帼文明岗”，院妇科被全国妇联命名为“巾帼文明示范岗”，院药剂科被团省委命名为“青年文明号”服务窗口，市新生儿疾病筛查中心连续五年被省中心评为先进集体。