舟山海洋科技馆位于国家重点风景名胜区——朱家尖北部海洋文化旅游区内，与海天佛国普陀山和普陀东港经济开发区隔海相望。主体建筑面积11276平方米。馆内设有海洋科技展区、海洋生物展区、海洋水族区、会展中心、休闲娱乐区、购物区，配置绿化、人工湖、雕塑、喷泉、景观照明等设施，是一座公园式展馆。舟山海洋科技馆是集海洋科技、海洋文化、科普教育、商业会展、休闲度假于一体的综合性园区。2000年7月动工，2003年9月竣工。2003年10月1日正式对外开放。

展馆主要展示十大门类海洋生物1400余种2000多件。有长12米、重约11吨大型巨鲸，重405斤中国魟，重3000余斤粗齿大海豚等现今六大全国之最和大型中华鲟，会吃人大型蜘蛛蟹、瓜螺、皇带鱼、旗鱼、金枪鱼、大口鲨、角鲨、海豚、海豹、海狗、特大梭子蟹王、12肢足梭子蟹、雌雄同体蟹、壳尖六角蟹、蛙蟹等许多大、奇、特海洋生物，以及来自新加坡、印尼、阿根廷等地的鱼类。科普展区展示了生态环境保护、珍稀水生野生动物保护内容，并增设了科普知识参与性、趣味性、娱乐性项目。设计了图文展版33块、知识竞猜展版42块，展台8个，在介绍鱼、蟹、虾、贝等海洋生物的同时，动静结合参与操作。1号馆展厅安装了世界一流、中国第一台大型360度环幕船舶模拟操作器、参观者可尽览世界著名港口景观。与此同时还展出了具有舟山特色的渔民画240余幅。室外配置二套大型冲气玩具和体育活动用具供参加者游玩。