中子干扰器为日本动画机动战士高达SEED中的一种机械。在故事设定下、在大战爆发初期、为了报复“血染情人节”之惨剧，由ZAFT开发、为抑制地球联合军使用核弹攻击而发射到地球上、其影响范围几乎囊扩整个地球。虽然成功封印的核子武器、但是也失去了核能、同时也干扰电子通讯、雷达等。

SEED的设定是由于扎夫特在地球上设置了许多能干扰中子活动的设备，由核反应的基本原理——链式反应可以知道，使原子发生裂变的方法是用中子轰击原子，由于干扰设备的原因，核反应在SEED的世界中无法使用，所以高达只能使用储存好的电能作为能量来源，直到搭载了中子干扰消除装置的ZGMF系列高达的出现，高达可以使用自带的核装置实现能源自给，所以消除器就是用来抵消中子干扰的。

在只须三基便可封锁地球的情况下，ZAFT为了防止中子干扰器被清除，所以便发射出不可计算之数量进入地壳内。虽然成功封锁了核子攻击、同时也因此令拥有大量人力和物资的地球联合军陷入苦战，但也因此令居住在地球上的自然人陷入能源短缺的危机，同时更加仇视调整者。此外由于失去了致命的王牌兵器，战况也因而进入了胶着状态。