黏膜免疫系统是有分布在呼吸道、消化道、泌尿生殖道以及外分泌腺等黏膜组织内的淋巴组织和免疫活性细胞共同形成的一个完整的免疫应答网络。

粘膜免疫系统的组成：

1 有结构的组织：称为黏膜滤泡，主要是肠相关淋巴组织和支气管相关淋巴组织。他们是免疫应答的传入淋巴区，抗原由此进入MIS（粘膜免疫系统），被抗原提呈捕获、处理和提呈给T、B细胞，引发免疫应答。

2 弥散淋巴组织：广泛的分布黏膜固有层中，它们是免疫应答的传出淋巴区，浆细胞和致敏淋巴细胞通过归巢机制迁至弥散淋巴组织，抗体和致敏淋巴细胞在此发挥功能。