该台观测始于 1971年国家地震局新疆地震预报研究队期间，由国家地震局地球物理研究所在小海子水库北闸附近架设两套地震仪开展试验研究性观测。其中一套573型短周期地震仪进行常规观测，放大倍数约10万倍。另一套473型地震仪布设了一个三角形小台网，分北、东、南三点，东—南为3Km，北—东为4Km，北—南为5Km，用于小震活动的研究工作。1975年5月该台交自治区地震办公室接管，1976年3月小台网停测。1978年在小海子水库附近修建了台站，573型地震仪迁入新台址。由于交通不便，生活条件差，1990年自治区地震局又在巴楚县城内修建了新台站，1991年架设了CDM-2型三分向遥测地震仪，1992年1月正式观测，同时停测573型地震仪。摆房设在小海子水库东侧麻扎塔格山前，高程为1 140m，台基为变质岩，放大倍数达10万倍。2000年11月架设FBS-3型宽频带数字地震计进行观测，停测了模拟记录部分。 巴楚台对新疆西部及毗邻地区的地震定位起到了重要作用，单台测震学资料对预报伽师地区的地震有一定的效能。