有隔菌丝(Septahypha):真菌是一类真核微生物，有复杂的分类系统。一般从形态上分为酵母菌、霉菌及担子菌三大类。其中霉菌菌丝可分为无隔和有隔两种。有隔菌丝是由分支成串的多细胞组成，菌丝中有隔，隔中央有小孔，细胞核及原生质可流动。

常见有隔霉菌：曲霉，种类多，数量广，有发达菌丝体，有隔膜，多细胞。大部分病原性丝状菌。