南朝宋泰始中置，治所在今广东电白县东北，属越州。齐仍。梁陈属高州。隋开皇十年（590年）废郡改为永宁县，后并入高凉郡杜原县。

另有，东汉兴平元年（194年），益州牧刘璋将巴郡一分为三：垫江以北为巴郡，江州至临江（今忠县）为永宁郡、朐忍（治今云阳县）至鱼复（治今奉节县）为固陵郡。建安六年（201年），永宁郡复称巴郡，郡治江州县。