药物作用的差异有些是由遗传因素引起的，研究遗传因素对药物反应影响的学科称之为遗传药理学（pharmacogenetics），它是药理学与遗传学相结合发展起来的边缘学科。遗传因素对药物反应的影响比较复杂，遗传物质的多态性是主要因素，因为酶和蛋白质是在特定基因的指导下合成的，基因的多态性，使合成的酶和蛋白质呈多态性，其性质和活性不同，影响了相关药物的反应。所以，遗传基因的差异是构成个体对药物反应差异的决定因素。