安徽农业大学职业技术学院系安徽农业大学负责高等职业技术教育的二级办学机构。与成人教育学院和现代农业管理与技术学院合署办公。学院下设教学管理部、继续教育部、后勤管理部等职能部室，现有在职工作人员26人，中共党员21人。

安徽农业大学高等职业技术教育兴办于1999年，是安徽省首批开展新高职教育的办学单位之一。现设有省农村经济干部管理学院、涉外经济职业学院等高职教育教学点，有英语、会计、市场营销、计算机应用与维护等新高职专科层次专业30余个，在校学生8000多人。职业技术学院校本部设有种子工程、园林、茶艺等特色专业，其中种子工程、园林为省级高职重点专业，种子工程是教育部确定的国家级高职高专教育教学改革试点专业。安徽农业大学高职新生以普通高考成绩为主要依据，从高分到低分择优录取。学生在校期间享受国家教育部和安徽省政府规定的各项政策待遇。