小盆景土壤较少，施肥须及时，否则易造成枝条枯萎。

成型后的小盆景施肥量随植物种类不同而异，观花为主的小盆景，开花后要施稍淡的肥料，以促使下一年多开花。观果的小盆景，可施稍浓的肥料，并在开花前追施1-2次淡肥。对于落叶性的盆景，不必多施肥，否则会引起生长过快，影响树型。盆景施肥宜在清明前后用浸盆施放稀薄的液肥，如绿肥和泡腐后的饼肥等。观叶类以氮肥为主，磷、钾肥为辅；而观花、观果类应多施磷、钾肥。施肥应在选晴天的下午四点以后最佳，盆土干旱时进行。梅雨季节，由于温度和湿度适宜，抽枝、发芽较快，应补充养料。

对于小盆景的施肥最好的方法是用浸盆法，即用水按比例稀释好后将小盆景整个盆土浸入稀释后溶液里浸透后取出。