噬菌体展示库(phage display library)的基本原理是将外源基因同丝状噬菌体fd或MB的外壳蛋白P8基因或P3基因融合后导入噬菌体基因组，表达产生的外源肽与外壳蛋白P8或P3形成融合蛋白，展示在噬菌体的表面。导入了各种各样外源基因的一群噬菌体，就构成一个展示各种各样外源肽的噬菌体展示库。当用一个蛋白质去筛查一个噬菌体展示库时，就会选择性地同与其有相互作用的某个外源肽相结合，从而分离出展示库里的某个特定的噬菌体，研究该噬菌体所含外源基因的生物学功能。 基于同一原理的另一种实验系统是将编码细菌表面的菌毛蛋白的基因，同外源基因融合，转入细菌细胞后表达，在细菌表面的菌毛中出现融合蛋白。当遇到能同外源基因的蛋白质产物相互作用的蛋白质时就能选择性地与融合蛋白相结合。这样，也就起到展示库的作用，可以筛选有相互作用的蛋白质。