南京大学淮安高新技术研究院于2008年6月29日正式成立，由南京大学与淮安市人民政府联合共建。研究院致力于将南京大学及其他科研院所的科技、教育、人才、品牌优势和淮安市特色产业及新兴产业优势紧密结合，构筑地方新技术高地，组建政产学研有机结合体系，着力打造技术研发公共平台、科技成果转化公共平台、高层次人才创新创业平台和地方人才培育平台。

研究院坐落在淮安市经济开发区高教园区承德南路299号，占地面积计划100亩，前期运作30亩。第一期建设5000平方米的实验和办公大楼于2010年11月10日揭牌并启用。现有实验室28间（21大间，7小间）、办公用房28间，多媒体报告会议室3间，展览厅1间，多功能报告厅1间，贵宾接待室1间。研究院已注册为淮安市科技局下属事业单位，独立法人，注册资金60万元。研究院未来三年的五个主要研发方向为：（1）盐化工新产品、新技术和新工艺及成熟产品和工艺的升级；（2）精细化工新产品、新技术和新工艺；（3）新材料；（4）新医药；（5）新能源产品及相关新技术和新工艺。同时根据淮安市经济发展需要，积极推进软件、电子产品等行业的研发。目前正在建设盐化工、氯化、催化加氢、功能高分子材料、医药、精细化工、化学能源新体系的新产品和新工艺研究实验室及相关公共仪器服务平台。

研究院通过优惠的政策、优良的环境、优质的服务吸引南京大学及其他科研院所、大专院校和企业的高层次研发团队和人才来淮安合作研发、创新创业，推动科技创新资源向淮安汇聚，促进创新资源在本地区的有效配置，形成区域经济可持续发展的创新动力。