棉子低聚糖（棉籽低聚糖）是一种从棉籽中提取的纯天然功能性低聚糖，主要成分是棉子糖。

棉子低聚糖为白色粉末，不吸湿，可方便添加于各种食品、保健食品之中。 棉子低聚糖于2010年被卫生部批准为新资源食品（详见卫生部2010年第3号公告）。

棉子低聚糖的主要成分棉子糖是自然界中存在最广泛的一种三糖，由半乳糖、果糖和葡萄糖结合而成，也被称为蜜三糖、棉籽糖。棉子糖能顺利地通过胃和肠道而不被吸收。棉子糖是人体肠道中双歧杆菌、嗜酸乳酸杆菌等有益菌极好的营养源和有效的增殖因子，具有整肠和改善排便的功能；它能改善人体的消化功能，促进人体对钙的吸收，从而增强人体免疫力，对预防疾病和抗衰老有明显效果；棉子糖还是人体和动物活器官移植用保护输送液的主要成分及延长活菌体在常温下存活期的增效剂。

北京中棉紫光生物科技有限公司一直专注于棉籽的精深加工，其中棉子低聚糖就是其主要产品之一。