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词条 SNP
释义

§ 简介

有的人吸烟喝酒却长寿,也有人自幼就病痛缠身;同一种治疗肿瘤的药物对一些人非常有效,对另一些人则完全无效。这是为什么?答案是他们基因组中存在的差异。这种差异很多表现为单个碱基上的变异,也就是单核苷酸的多态性(SNP)。

§ 单核苷酸多态性(SNP)

SNP(读成斯你普)代表Single Nucleotide Polymorphism,即单核苷酸的多态性。

是指在基因组上单个核苷酸的变异,包括置换、颠换、缺失和插入。从理论上来看每一个SNP 位点都可以有4 种不同的变异形式,但实际上发生的只有两种,即转换和颠换,二者之比为2 :1。SNP 在CG序列上出现最为频繁,而且多是C转换为T ,原因是CG中的C 常为甲基化的,自发地脱氨后即成为胸腺嘧啶。一般而言,SNP 是指变异频率大于1 %的单核苷酸变异。在人类基因组中大概每1000 个碱基就有一个SNP ,人类基因组上的SNP 总量大概是3 ×106 个 。

如果从大街上随便找两个人,比较他们的DNA,它们的组成将有99.9%相同。再打个比方,也就是说,在DNA中的1000个碱基中,将有999个完全一致,只有1个不同。这个不同的碱基位点,就叫做SNPs。它让我们与众不同。

当人体产生新的细胞时不会有太多的错误,但是没有一个人是完美的。有时当基因组被复制的时候,一个单碱基被拿走,增加或替代,单个碱基的替代就产生了SNP在人体的基因组中大约有1000万个SNPs,这就造成了您和地球上其他人的不同。

例如,假设在90%的人口中,在第二条染色体的某段位置,DNA序列是ATGCCCGT,而在10%的人口中,是ATGCACGT。整个序列除了第五个碱基不同外(90%的人群是C,而10%的人群是A),其他都一致。由于在这个位点存在这两个不同的等位基因,我们就称之为单核苷酸的多态性。

一些SNPs影响基因的功能—基因的关闭或开放,等。如果一个基因在身体里扮演重要角色,那么它的SNPs的等位基因将导致明显的生理上的不同:表现型的不同。这些SNPs的不同可能有好处(如乳酸的耐受),没变化(头发颜色)或害处(Tay-Sachs病)。

有一些SNP造成了外貌的不同,其他的可能影响我们是否会得某种疾病以及对不同药物的反应,但是大多数SNP似乎不会产生可察觉到的不同。因为这些变异一代传到下一代,您SNP不同点的数目可以决定您和其他人的相似程度。

因此,SNP成为第三代遗传标志,人体许多表型差异、对药物或疾病的易感性等等都可能与SNP有关。

现在普遍认为SNP研究是人类基因组计划走向应用的重要步骤。这主要是因为SNP将提供一个强有力的工具,用于高危群体的发现、疾病相关基因的鉴定、药物的设计和测试以及生物学的基础研究等。SNP在基因组中分布相当广泛,近来的研究表明在人类基因组中每300碱基对就出现一次。大量存在的SNP位点,使人们有机会发现与各种疾病,包括肿瘤相关的基因组突变;从实验操作来看,通过SNP发现疾病相关基因突变要比通过家系来得容易;有些SNP并不直接导致疾病基因的表达,但由于它与某些疾病基因相邻,而成为重要的标记。SNP在基础研究中也发挥了巨大的作用,近年来对Y染色体SNP的分析,使得在人类进化、人类种群的演化和迁徙领域取得了一系列重要成果。

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更新时间:2024/11/11 11:40:07