江苏省紫菜协会于2003年 2月15日在南京成立，是我国首家民间省级紫菜协会，旨在提高行业发展的组织化程度，提高产业发展的质量技术水平，开拓紫菜的国内外市场。

首任秘书长为端木怡燕。江苏省紫菜协会是由海安兰波实业公司、南通海达水产食品公司等一批紫菜生产加工骨干企业牵头发起，同业经济组织和相关单位自愿加入，按照市场经济模式运作，实行"自愿入会、自理会务、自聘人员、自筹经费"的原则组建的，首批发展会员89个，其中单位会员72个，个人会员17个。从会员的组成看，既有国有企业、股份制企业，又有私营企业、中外合资企业、外资企业以及科研机构和热心紫菜行业的个人，具有较强的行业协会代表性。

江苏的条斑紫菜业经过30年的发展，成为全省海洋渔业经济中的支柱产业。养殖加工均有一定的规模。其中90%以上的产品出口外销，养殖规模和产量占全国条斑紫菜的95%以上，形成了紫菜种质保存、良种培育、育苗、栽培、一次加工、二次加工、机械制造和批发市场配套完整的产业体系。但是，日本多年来一直将干紫菜和调味紫菜纳入进口配额产品目录，对原产于哪个国家的紫菜能进口以及进口数量的多少，完全由日本政府加以严格控制。日本只对原产于韩国的该类紫菜产品发放进口配额，从而导致中国同类紫菜产品对日出口多年来一直为零。我国生产的同类紫菜价格长期还不到日本本国生产的三分之一。而2002～2003年度我国干紫菜总产量达到23亿张，其中江苏省产量为22亿张，由于我国条斑紫菜产品不能进入日本市场，约1/3的紫菜产品由日本有关紫菜商社低价采购后再转销到其他国家和地区，致使我紫菜产业损失惨重。2003年以前，在我国南通瑞达紫菜机械仪器研究所研制出国产化全自动紫菜加工机组以前，国内紫菜加工设备、零件基本都是从日本引进的，近20年来累计超过4000万美元。日本一方面向中国出口大量相关机械设备，另一方面又禁止中国紫菜的进口。

江苏紫菜协会成立之后，针对日本政府对中国紫菜贸易的歧视性做法，向商务部公平贸易局提出申请，请求调查并认定日本政府在紫菜进口方面存在贸易壁垒，并要求在此基础上与日本政府进行磋商，以促使其取消对于原产于中国的条斑紫菜的进口限制。目前已取得一定成效。

近年来，江苏省紫菜协会逐步建立了优质条斑紫菜育、养、加、销科技公共服务平台，通过积极引进紫菜新品种、新技术，对紫菜从业人员进行技术培训、指导、完善销售网络、完善检测手段等方式，优化了紫菜生产环境，提高了促进了紫菜产品质量，紫菜市场有序竞争，促进农业增效、农民增收，提高了国际竞争力。