吉首大学体育科学学院于2004年成立，前身为吉首大学体育系，创建于1978年。坐落在湘、鄂、渝、黔四省市边区地段，孕育在青山绿水、繁花锦簇的湖南湘西州吉首市，濒临历史文化古城凤凰。她享受着少数民族文化熏陶，有独到的办学特色，是湖南西部体育人才培养的摇篮。

吉首大学体育科学学院自创办至今，经过26年的自力更生，艰苦奋斗，不断提高教学质量和办学水平，已为国家培养体育专门人才1500余名。多年来，在培育“体育文化人”理念的指导和在民族传统体育学科研究的带动下，坚持以学科建设为“龙头”，以专业建设为支撑，取得了长足发展。学院1999年获准设置体育教育本科专业，2001年体育教育专业被湖南省教育厅确定为省级重点建设专业，该专业立足湖南西部，辐射湘、鄂、渝、黔四省市边区，定位为民族地区培养“下得去、用得上、留得住”的具有现代意识和民族特色的新型体育复合性人才。 2001年被湖南省民族委会员确定为湖南省少数民族传统体育训练基地，2003年被国家体育总局确定为国家少数民族体育重点研究基地。经国务院学位办批准民族传统体育学和体育人文社会学获硕士学位授予权，分别从2004年、2007年开始招收硕士研究生。近年来，学院面向全国28个省市招生。现有在校本科生、硕士研究生、成教学员共1200余人。

26年的沧桑，26年的辉煌。学院大力加强师资队伍建设。现有正高职称7人，副高职称15人，博士1人，外聘客座教授8人，享受国务院特殊津贴1人，全国教育系统劳动模范1人，湖南省优秀青年社会科学专家1人，湖南省优秀青年专家1人，曾宪梓教育奖1人，湖南省高校体育学科带头人1人，全国师德先进个人1人，省级青年骨干教师7人。长期以来，这支队伍奋发进取，自强不息，以民族传统体育为基点，并结合当地文化风情，在学科领域深入探索，获国家哲学社会科学规划办课题10项，教育部、国家体育总局、湖南省哲学社会科学规划办等省部级课题30余项；在省级以上刊物发表论文256篇，其中核心刊物48余篇，8篇论文被《人大复印资料》全文复印，4篇被《新华文摘》全文转载和摘登；出版专著教材24部。