机理法是在研究系统运行机理的基础上提出假设，然后建构模型。系统工程的研究对象设计各种领域，很难概括出通用的方法，只有从专业的角度研究该对象的运行特点，才可能建构合适的分析模型。而机理法是其中很常见的一种方法。

比较常见的应用如下：

一、传销模型

二、最短停车间距模型

机理法具有范围广、物理意义明确的优点。