| 词条 | 基因组可视化 |
| 释义 | 基因组可视化，即对基因组数据进行可视化，通常指对最基本的基因组DNA序列，和注释数据等基因组相关的分析数据，按照一定的用户友好方式，使用图形元素表达出来，方便视角直观地识别已知或未知的数据模式，或者比较差异等。 典型的基因组可视化方式有基因组浏览器，Circos软件包绘制等。 简介基因组可视化，即对基因组数据进行可视化，通常指对最基本的基因组DNA序列，和注释数据等基因组相关的分析数据，按照一定的用户友好方式，使用图形元素表达出来，方便视角直观地识别已知或未知的数据模式，或者比较差异等。 典型的基因组可视化方式有基因组浏览器，Circos软件包绘制等。 基因组可视化 属于 “数据可视化”的一种，相当于数据可视化理论方法在基因组学数据上的具体应用。由于基因组数据的独特性，因此又有着一些独特的可视化方法产生。Circos就是一个典型的例子，它最初就是为了可视化基因组上的变异数据和比较基因组学数据等，后来发展到可以用于很多领域的关系型数据的可视化。 实例项目基因组可视化的实际项目不算很多，但现有的都非常典型，除了主流的基因组浏览器外，还有其他很多的方向，如芯片数据的可视化，比较基因组学数据的可视化，进化相关的如基因树的可视化等。 基因组浏览器1 NCBI 2 Ensembl 3 UCSC 4 开源项目-GMOD ：GBrowser 5 Venter genome browser : 6 JBrowse 7.UTGB 其他 基因组可视化相关的软件包1 Circos 2 .IGB 3.IGV 4.SAVANT 5.Eagle View 其他 进化树相关的软件包1 treeview 2 其他... 发展和研究现状目前并未独立出一个学科叫做“基因组可视化”，但实际研究和工作中，确实有一部分科研人员在从事这个方向的工作，并且他们以基因组浏览器和基因组学产出数据的图形化表示为两大主要方向。 由于“数据可视化”本身的理论方法的发展滞后于其应用，因此“基因组可视化”目前（2010-7）也并未有系统的理论方法描述，只是一个术语和提法，并不断地被大家所认识、接受、发展、拓宽。 发展和研究前景由于整个数据可视化/信息可视化领域今年发展迅速，部分业内人士正发起和计划推进这个领域的理论和方法学发展，因此基因组可视化也是一个非常有前景的方向。对于生物信息学的开发人员，可以开发基因组可视化方面的软件包或者web应用等，对于科研人员，则可以研究基因组数据本身的特点与可视化方法之间的关系，提出改进的甚至新的可视化方法。 |
| 随便看 |
百科全书收录4421916条中文百科知识，基本涵盖了大多数领域的百科知识，是一部内容开放、自由的电子版百科全书。