2009年6月28日，洪都拉斯在美国的背后支持下发生军事政变，总统塞拉亚被军方扣押，其后被最高法院罢免而流亡。因执意推动修宪公投，塞拉亚与议会、军队和最高法院等陷入对立。29日，临时政府新内阁成员宣誓就职。这场政变的发生表明，拉美国家民主体制的政治经济基础仍然存在脆弱性。

经过：驱逐总统

起因：修宪公投

国际：纷纷谴责

前景：扑朔迷离

经过：驱逐总统

2009年6月28日早晨6时许，4名军官带领约200名全副武装的士兵强行闯入曼努埃尔·塞拉亚所在的总统府，在同总统府警卫人员进行长达20多分钟的对峙后，用车将塞拉亚押送至位于首都特古西加尔巴的一处空军基地，随后将他秘密转移到哥斯达黎加境内。洪都拉斯总统私人秘书雷纳对新华社记者说，塞拉亚总统当天被军方扣押表明洪都拉斯已经发生军事政变，随后总统本人在哥斯达黎加宣布了这一消息。截至9时许，洪军方已完全控制了首都特古西加尔巴的主要街道，同时切断了首都和外界的交通往来。

另据报道，塞拉亚在哥斯达黎加首都圣何塞说，自己遭到洪都拉斯一部分军人的“野蛮绑架”。“作为洪都拉斯总统，我现在在圣何塞。我还将作为洪都拉斯总统赴尼加拉瓜首都马那瓜。我要寻求洪都拉斯人民的权利。我的任期应于2010年结束。”他表示自己并没有辞职，依然是洪都拉斯的合法总统，并呼吁国际社会和美洲国家组织尽快阻止正在发生的政变以保证洪都拉斯的稳定。

目前，大批军队在总统府、议会大厦和最高法院等重要地点集结，装甲车和直升机不断在首都地面和上空进行巡视。而总统塞拉亚的支持者仍继续在总统府附近与军方对峙，但双方未爆发大规模冲突，局面基本稳定。

当天，洪议会举行紧急全会，宣布废黜塞拉亚，并按宪法规定任命罗伯托·米凯莱蒂为临时总统，判定军队驱逐总统行为“合法”，同时宣布11月29日的总统选举将如期举行。

起因：修宪公投

军事政变缘起即将于6月28日举行的全民公投。这次公投是由塞拉亚极力推动的，旨在于11月总统选举期间成立制宪大会修改宪法。但塞拉亚所属的自由党、反对党国民党、议会、法院、军方均对此强烈反对，认为塞拉亚有意借此谋求连任，修宪是破坏民主之举。

6月24日，由于军队总参谋长巴斯克斯在公投问题上采取不合作态度，塞拉亚宣布解除其职务。随后，洪最高法院宣布全民公投“违法”，总统解除巴斯克斯职务决定“无效”。但塞拉亚拒不更改立场，并于27日宣布尽一切力量推动修宪公投，并称这是一场“展示人民力量的斗争”。

国际：纷纷谴责

国际社会纷纷对洪都拉斯军队拘押并驱逐总统的做法表示谴责。

联大主席米格尔·德斯科托·布罗克曼28日发表声明，对洪都拉斯发生的政治事件表示“明晰、断然、确凿无疑的谴责”。

联合国秘书长潘基文28日发表声明说，他坚定支持洪都拉斯民主体制，并谴责洪都拉斯军方扣押总统塞拉亚的行为。他敦促尽快使塞拉亚恢复总统职位，呼吁有关各方通过和平方式解决分歧。

美洲国家组织28日下午紧急召开会议，34个成员国代表一致谴责洪都拉斯军方采取的极端措施，要求立刻恢复塞拉亚作为合法总统的职务。美洲国家组织秘书长因苏尔萨呼吁国际社会携手反对这一严重破坏美洲大陆民主进程的行径。

由委内瑞拉倡导成立的“美洲玻利瓦尔替代计划”组织成员国纷纷表态谴责洪都拉斯军事政变。特别是同塞拉亚关系密切的委内瑞拉总统查韦斯，在事件发生后多次向媒体表示，如果情况有变，委方将不吝出动军队，以恢复塞拉亚的合法地位。查韦斯还于28日晚间抵达尼加拉瓜首都马那瓜，出席针对洪都拉斯军事政变而召开的“美洲玻利瓦尔替代计划”成员国紧急首脑会议。

前景：扑朔迷离

被罢免的洪都拉斯总统塞拉亚28日晚间抵达尼加拉瓜首都马那瓜，出席当晚召开的“美洲玻利瓦尔替代计划”成员国紧急首脑会议和29日举行的中美洲一体化体系成员国紧急首脑会议。塞拉亚是乘坐由委内瑞拉政府提供的专机由哥斯达黎加抵达马那瓜的。

分析人士认为，以下几个因素都有可能对洪都拉斯未来政局走向产生影响：

其一，塞拉亚的国内支持者如何反应。由于塞拉亚上台后实行了一系列倾向中下层民众的政策，扩大政府在教育、医疗等领域的资金投入，扶持低收入群体脱贫增收，因而塞拉亚在农村和中下阶层拥有众多支持者。如果塞拉亚的支持者反应比较强烈，国内局势有可能向紧张方向发展。

其二，执政党和在野党能否达成共识。由于此次动荡局面源于执政党自由党同在野党共同反对塞亚拉的公投提议，因此如果执政党和在野党就洪都拉斯政局问题达成共识，洪都拉斯政坛将重新分化组合。

其三，外国、地区组织以及国际社会采取何种应对措施。目前有关国际社会都在向洪都拉斯政变一方施加压力，并且尚不排除一些国家或组织进行干预甚至是军事干预的可能性，这对洪都拉斯政变一方构成了很大的压力。